古代人骨ＤＮＡ解析の説明（素人作成メモ）

DNA解析とは（素人による素人のための参考メモ）

プロジェクトで書かれている用語が難しくてよく分からないので説明してほしいとの声がありましたので、事務局（素人です）作成のものを載せます

（専門家が書いたものではないので、不正確な点はご容赦下さい。）
第１　用語の説明
　ＤＮＡ：細胞内の化学物質で、このＤＮＡに書かれているヒトをつくる設

　　　　　計図の情報が染色体に記録された遺伝子である。
　ゲノム：遺伝情報の全体のことである。
　ミトコンドリア：細胞内の構造物の一つで、一つの細胞にたくさん含まれ

　　　　　　　　　ている。
　ミトコンドリアＤＮＡ：ミトコンドリアの中のＤＮＡで母系遺伝をする。
     　精子と卵子が結合した時点で、精子のミトコンドリアは消滅し、卵子の

　　ミトコンドリアだけが生き残るため。
　ミトコンドリアゲノム：約１万６５００個の塩基の連なり
   核 　：　　細胞の核で、その中にぎっしりと遺伝情報が詰まった染色体　            を含んでいる。
   核ゲノム：　約３０億の塩基からなる。
   ＳＮＰ解析：核ゲノムの比較に用いられるゲノムのＤＮＡ配列の中にある   　　　           　　　　塩基の違い（一塩基多型）に絞って行う解析
              ＳＮＰを調べる技術は２１世紀になって開発された。
              ＳＮＰは集団の中で突然変異によってランダムに生まれるので、別

　　　　　れてまもない集団には共通するＳＮＰが多く、はるか昔に別れた集

　　　　　団同士では、お互いに別の集団のＳＮＰが蓄積されているので、共

　　　　　通するＳＮＰは少なくなる。
   全ゲノム解析：核のゲノムを全部調べる方法
                ミトコンドリアＤＮＡ解析に比べ、情報量が圧倒的に増え、男系と

　　　　　女系の双方の情報を総合した分析が可能
                古人骨のゲノム解析可能になったのは、２０１０年以降
　ハプログループ：ヒトが世界に拡散する過程で突然変異により様々な系統　

　　　　　　　　に別れていくが、それぞれの系統をハプログループとい

　　　　　　　　う。
                  ハプログループにより、どの系統に属するか分かる。
第２　ミトコンドリアハプログループ
　  １　現在の本土日本人が所属するハプログループの種類
　　　　Ｄグループ、Ｂグループ、Ｍ７グループ、Ａグループ、Ｇグループ、 

　　　　Ｆグループ、Ｎ９グループ、Ｎ８グループ他、実に多種のハプログ

　　　　ループがある。
        注目は、縄文人に遡るＭ７aとＮ９b。
　　　　（篠田謙一　「日本人になった祖先たち」　ＮＨＫブックスより）
        ①ハプログループＤ
        　　　Ｄ４　３２．６１％の人
              Ｄ５　　４．８０％の人
              日本人の中で最も多い集団
        　　　南回りで東アジアにやってきた集団の中から中国大陸中部で誕生

　　　　　した集団と推定
              東アジア全体でも最大のグループ、特に中国東北地方、朝鮮半島

　　　　人口の３割から４割を占める。
        ②ハプログループＢ
              Ｂ４　　８．９９％の人
              Ｂ５　　４．２７％の人
              約４万年前に中国南部で誕生した集団と推定
             中国南部から東南アジアにかけて人口に占める割合が多い。
              １万５０００年以上前に新大陸に渡ったグループ
        ③ハプログループＭ７
              Ｍ７ａ　　７．４７％の人
              Ｍ７ｂ      ４．４５％の人
              Ｍ７ｃ　　０．７６％の人
              氷河期に存在していたスンダランドで誕生したと推測
              沖縄が最も頻度が高く、北に行くほど頻度が低いので、日本へは南

　　　　から入ってきたグループと推定
              Ｍ７ａは縄文人にまで遡る。
        ④ハプログループＡ 　６．８５％の人
              主に中央アジアから北アジアぬ分布
              北東シベリアや北アメリカの先住民では人口の過半数を占める。
        ⑤ハプログループＧ 　６．８６％の人
              分布は北方に限定。
              誕生は約３万年前　シベリア高原と推定
        ⑤ハプログループＦ 　５．２４％の人
              東南アジアでは最大のグループ
              ４万年以上前に東南アジアで誕生
        ⑥ハプログループＮ９ 　５．２４％の人
          　 Ｎ９ａ　　４．５７％の人
        　   Ｎ９ｂ    ２．１３％の人
         　  Ｙ
             Ｎ９ａは、中国南部や台湾の先住民に多い。
　　　　 Ｎ９ｂは、縄文人にまで遡り、日本以外では見られない。
            北に行くほど人口に占める割合が多いので、北から日本に入ってきた

　　　グループと推測
             Ｙは北東シベリア沿海州の先住民に多く見られる。
            アイヌ民族に多く見られるグループ　本土の縄文人からも北海道の縄

　　　　文人からも発見されていない。
        ⑦ハプログループＭ８ａ 　１．２２％
             漢民族の集団の中に一定の割合で存在
              中国北部で誕生したグループと推定

  　２　縄文人骨のミトコンドリアハプログループ
        縄文人骨はＭ７ａとＮ９ｂという２種のハプログループが多数を占め

　　　る。
        地域差があり、関西以西では Ｍ７ａが卓越、北海道・東北ではＮ９ｂが

　　　多数
        　Ｍ７ａの成立は、３万年～２万年前で、縄文時代の開始時期よりも前

　　　の旧石器時代に南から日本列島にきたものと推定。
    ３　ミトコンドリアハプログループから分かること
    　①　現代の日本人集団は、均一の遺伝子を持つ集団ではなく、多方面から

　　　　日本列島にやってきた多様な遺伝子を持つ集団が緩やかに混合した集

　　　　団である（アジアの広い地域からのＤＮＡ系統が集まっている。）。

    　②　縄文人は沖縄から北海道まで遺伝子的に均一の集団ではなく、 

　　　　　地域差がある。＜ーーーＭ７ａ南方ルートのグループとＮ９ｂ北　

　　　　方ルートの存在
      ⓷　一般には、縄文は関東以北の東日本を中心とした文化であり、縄文時

　　　代を通じて多くの人口を抱えていたとされるが、現代に繋がる縄文のＤ

　　　ＮＡは西日本のものが多くなる。
      ⓸　関東縄文人はハプロタイプＭ１０の頻度が最も高いが、他集団では見

　　　つからない。ーー＞現代の日本列島人に近い。
      ⓸　日本列島に最初に到達した旧石器人は約４万年前のことと推定されて

　　　おり、、縄文人に繋がる旧石器時代人とは異なる集団であった可能性が

　　　ある。
第３　東北縄文人の核ＤＮＡの解析結果
      核ＤＮＡの膨大な塩基配列データは、次世代シークエンサーの開発により

     可能となった。
     主成分分析等の分析結果、縄文人は、現代のアジア人とも、北東アジ

　　ア人とも近くなかった～出アフリカ後初期に分岐した集団か？～。
      即ち、出アフリカをしたヒトの集団から東ユーラシア系統と西ユーラ　

　シア系統に分岐した後、いくつかの大きな分岐の後、１万５０００年以

　上よりずっと前に、東北の三貫地縄文人系統と、「現代の東アジア人と

　　南米人」につながる系統（その後、東アジア人系統と南米人系統に分岐、

　　東アジア人系統はその後さらに５集団に分岐）に分岐したと推定されて　

　いるーーー＞縄文人は極めて特異な集団
　　  西日本縄文人は、データなし ーー＞古代出雲人骨解析の重要な意義

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　がある。
                                                              　　　　　　　　　以上